Telah berdiri bangunan yang terdiri dari bangunan Gedung Administrasi, Gedung Pendidikan, Perpustakaan, Musholla, UKS, Ruang Guru, Ruang Kepala Sekolah, Laboratorium Komputer, Laboratorium IPA, Asrama Putra, Asrama Putri, Koperasi, Ruang Kelas, Ruang IPM, Ruang Bendahara, Ruang Tata Usaha, dan Ruang Studio. Alhamdulillah tahun 2025 sedang dibangun Ruang Serbaguna Lantai 3 SMP Muhammadiyah 1 Modern Boarding School.

SMP Muhammadiyah 1 Modern Boarding School Samarinda dilengkapi dengan 9 CCTV dan Jaringan Wi-Fi dengan kecepatan 150 mbps. Setiap ruang kelas dilengkapi AC, papan tulis, meja, kursi, dan dispenser. Fasilitas pendukung kegiatan peserta didik di asrama yaitu lemari peserta didik.